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[资源分享] 浙江大学生物信息学札记
PMID: 20036612 组学 调控网络 生物信息学
Current Opinion in Plant Biology
Available online 28 December 2009.
Omics meet networks — using systems approaches to infer regulatory networks in plants ![]()

各种组学数据库的结合应用,来研究代谢调控网络。
PMID: 19717332 植物细胞信号的顺式作用元件
Curr Opin Plant Biol. 2009 Oct;12(5):643-9.
Cis-regulatory elements in plant cell signaling. ![]()
某位叫周峰的著名博士极力推荐之……哈哈
文章提供了很多寻找顺式作用元件相关的工具,网址之类,确实挺有用。
[工具] Novagen pET 蛋白表达 Manual
[工具] 质粒图谱相关网站
早上正好在帮人找质粒图谱和序列,几个相关网站放上:
http://www.cambia.org/daisy/cambia/585.html pCambia系列载体
http://products.invitrogen.com/ivgn/en/US/adirect/invitrogen?cmd=IVGNcatDisplayCategory&catKey=82401 invitrogen公司的载体集
https://www.lablife.org/ct?a=listvecinfo 按照载体骨架寻找的数据库
http://www.embl-hamburg.de/~geerlof/webPP/vectordb/bact_vectors/table.html 这个是搜索到的,应该是一些比较常用的载体
各大生物论坛其实也是寻找图谱,甚至和别人交换有用载体的好地方……
PMID: 19915012 生物信息学 信号传导模型
Plant Physiology Preview , Published on November 13, 2009
Bioinformatic and systems biology tools to generate testable models of signalling pathways and their targets ![]()
利用生物信息学工具,结合转录组学蛋白组学的信息,如何有效建立信号传导途径的网络模型?该文章讲的是拟南芥,涉及很多网址、数据库、软件,有兴趣的参考吧。
[整理] 几个主要杂志的订阅源
[工具] 2008 影响因子 xls
[整理] 专业相关网址收集
这两天真没有什么论文更新,也没有啥好新闻,帖些自己收集的专业方面的网址吧,不全,笑纳。
Bio Company
Clontech-RNAi Designer RNAi干扰的设计
pCambia Vectors 各种载体的图谱
[整理] EndnoteX 教程(pdf,ppt)
Endnote 由Thomson Corporation下属的Thomson ResearchSoft 开发。基本功能:
一、在线搜索文献:直接从网络搜索相关文献并导入到Endnote的文献库内;
二、建立文献库和图片库:收藏,管理和搜索个人文献和图片、表格;
三、定制文稿:直接在Word中格式化引文和图形,利用文稿模板直接书写合乎杂志社要求的文章。
【软件工具】常用生物软件
新开“软件工具”分类。有空介绍或者转帖一些生物软件的用法,以及网络上各种数据库使用分析之类,也可以讲讲Excel用法之类,虽说比较简单,但还是有人需要的。分类差不多就固定下来了。
做生物实验常用软件有挺多,在生物软件网有比较全的整理,要下载破解版的话,只要不是太偏的软件,搜索都能找得到。其实使用一些在线的工具也是个办法,比如生物软件网的序列处理在线工具包(SMS),应付简单的一些序列分析是没有问题的,国外的比如SoftBerry,偏于蛋白分析的ExPASy等等,自己知道的也不多,欢迎大家补充。

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