Deciphering the splicing code
科学网评论
加拿大多伦多大学教授布雷登·费雷率领的研究团队发现，在DNA中一个隐藏的“剪接密 码”可用来解释为什么有限数目的人体基因能够产生出如此巨大数量的遗传信息。相关文章将发表在5月6日出版的《自然》（Nature） 杂志上.
该发现揭开了遗传学研究中最主要的奥秘之一。科学家可据此来解释活细胞如何使用有限数量 的基因生成如大脑一样非常复杂的器官。科学家认为，该发现弥合了多年来人类对基因组的认识和对细胞内复杂生产过程的认识之间存在的鸿沟，有助于预测和防止 癌症及神经退行性疾病的产生。
Nature , 25 March 2010
Haploid plants produced by centromere-mediated genome elimination 全文下载
那天和师妹讨论但单倍体的纯和优势，水稻单倍体培养主要通过花粉组培，但并不是所有植物都能“接受”这种方式。NATURE的这篇文章提供了一个新思路.cool ～ 
单倍体植物（仅从一个亲代遗传染色体）在遗传研究中有重要优势，在植物育种中也极为重要——它们被用来生成纯合子二倍体，从而避免很多代的近亲繁殖。单倍体的培育目前主要2种方式：配子体培养或者从少量种间杂交可以诱导出来，但总有局限范围。Maruthachalam Ravi 和 Simon Chan开发出一种通过种子来生成单倍体拟南芥的简单方法，该方法可以很容易被推广到农作物。
阅读全文…
Plant biologists fear for cress project 
Is enthusiasm withering for funding studies into Arabidopsis thaliana?
文中说到很多国家的基金已经开始限制对拟南芥研究资金投入，开始转向真正的作物研究，具体看文章。。。
Nature ，8 February 2010
Control of Arabidopsis apical–basal embryo polarity by antagonistic transcription factors
我们知道细胞都有极性，胚更有apical–basal axis，将来会分化出shoot/root顶端分生组织，目前知道这种极性是由PLETHORA (PLT) genes所控制，这篇文章 阅读全文…
Nature 462, 799 (2009)
Cold-induced silencing by long antisense transcripts of an Arabidopsis Polycomb target 
FLC是控制开花的重要基因，植物体内存在大量的non-coding RNA，这些ncRNA的作用并不清楚，在此之前已经发现了FLC的antisense转录本，并且知道在持续的冷处理时，植物的FLC基因会被Polycomb 家族蛋白 PHD–PRC2 complex所抑制，这就是春化作用。在这篇文章里，作者发现在持续冷处理情况下，FLC基因会产生大量的antisense长转录本，而正义转录本下降，并且这与春化作用的一些marker基因无关。用FLC基因的antisense转录本的启动子加在一个35S-GFP的下游，发现在冷处理下GFP也会被抑制。作者的结果说明了在冷诱导下，FLC基因产生大量的反义转录本，这一过程在FLC的沉默早期起到重要作用，进而招募Polycomb机制。并且这种机制也许是一种普遍机制，在特殊时期或条件下，通过反义的转录本来调节正义转录本的表达。
阅读全文…
Nature Genetics 41, 1275 – 1281 (2009)
The genome of the cucumber, Cucumis sativus L.
Science玉米基因组出来后，Nature也不甘落后。18个合作单位9个是China。关于重要性见正文Abstract。
阅读全文…
Nature advance online publication 6 November 2009
A gate–latch–lock mechanism for hormone signalling by abscisic acid receptors
nature article的文章，自然不用多说，ABA受体一直争议颇多，直到去年这个时候才差不多有定论，这篇文章解出了受体的结构以及结合ABA后结构的变化，阐明了作用机理，具体看文章。
Nature. 2009 Oct 22;461(7267):1130-4.
Unexpected consequences of a sudden and massive transposon amplification on rice gene expression. [下载]
真核生物基因组充斥大量高拷贝的转座子，这些转座子在基因和基因组进化中起到重要作用。难以解释的是，宿主基因组怎么可以在很短时间内，承受住这么多插入片段的冲击。以前我们报道过在某些水稻品种中，转座子mPing每代、每单株可以增加约40个拷贝，这次通过大量测序和Microarray分析，表明绝大多数转座子的插入不会影响基因的转录水平(上调或者无影响)。另外比较新奇的发现是：某类mPing转座子的插入，使得邻近的基因可以受逆境诱导表达(Amazing，调控网络本来就构复杂，还来这么一条……)。
发Nature的原因：第一次阐述转座子等重复元件在genome restructuring 和gene regulation中的作用。
阅读全文…
评论 Comments